Holoenzyme-komponenter: (1) Core-enzymet och (2) Sigma-faktorn
E-coli-komplett RNA-polymeras är känt som holoenzymet. Holoenzymet består av följande två komponenter: (1) kärnenzymet och (2) sigmafaktorn. Holoenzymet kan symboliseras som a2p3 'a. !
1. Kärnenzymet:
Kärnenzymet kan inte initiera transkription på de korrekta ställena, men det kan syntetisera RNA med användning av DNA som en mall.
Kärn-RNA-polymeraset består av fyra polypeptider som har följande tre typer:
(a) a-underenheten:
Det är närvarande i två kopior / kärn-enzymmolekyler, och är inblandad i bindning med promotor-DNA. Den exakta mekanismen för dess bindning med DNA är okänd.
(b) P-underenheten:
Det är närvarande i en enda kopia / enzymmolekyl, och är involverad i bindning med inkommande nukleotider för RNA-syntes. Anmärkningen av de korrekta nukleotiderna motsatta DNA-baserna verkar vara baserad på deras övergripande geometri i förhållande till varandra snarare på basparets beteendebeteende.
(c) P-subenheten:
Det är involverat i bindning med mall-DNA, dvs den enkelsträngade DNA-sträckningen genereras för att tillåta transkriptionen att fortsätta.
Varje subenhet bidrar till funktionen av kärnenzymet som en helhet, som bör ha åtminstone följande fyra distinkta funktionella platser.
(i) En DNA-avvecklingsplats som håller att avveckla DNA-duplexen när kärnenzymet rör en bas i taget längs DNA som transkriberas.
(ii) Platsen bindande till "antisenssträngen", strängen som transkriberas.
iii) En annan plats binder till "sense-strängen", strängen komplementär till "antisenssträngen" av DNA-transkriberingen.
(iv) Ett DNA-återspolningsställe är avsett att återspola de två strängarna av DNA till en normal duplex.
2. Sigma-faktorn:
Sigma-faktorn är involverad i stabil bindning av RNA-polymeraset till promotor-DNA; och eventuellt med transkriptionsinitiering. Det är inte inblandat i transkriptionen i sig (dvs. RNA-syntes) som den släpps när RNA-kedjan når 8-9 baser; kärnenzymet fortsätter sedan transkription.
RNA-polymeras i eukaryoter:
Alla eukaryoter har tre separata klasser av RNA-polymeras som kallas RNA-polymeras I, RNA-polymeras II och RNA-polymeras III.
RNA-polymeras I:
Detta enzym ligger i nukleolus och ansvarar för transkriptionen av ribosomalt RNA.
RNA-polymeras II:
Detta polymeras är belägen i nukleoplasman som är en del av kärnan annan än nukleol. Detta enzym är huvudkomponenten av RNA-polymerasaktivitet, och det transkriberar alla gener som producerar mRNA. I eukaryoter är transkriptet initialt i form av mRNA-prekursorer, som heter heterogen nukleär RNA (hn RNA) som senare behandlas till mRNA.
RNA-polymeras III:
Detta enzym inträffar i nukleoplasma och transkriberar tRNA- och 5S-RNA-gener.
Organellar RNA-polymeras:
Förutom de nukleära RNA-polymeraserna I, II och III har eukaryota celler en liten mängd RNA-polymerasaktivitet i deras organeller, dvs mitokondrier och plastider. Dessa polymeraser är nödvändiga för att transkribera relativt få gener närvarande i dessa organeller. Dessa enzymer verkar vara analoga med fag RNA-polymeraser.