Holoenzyme-komponenter: (1) Core-enzymet och (2) Sigma-faktorn

E-coli-komplett RNA-polymeras är känt som holoenzymet. Holoenzymet består av följande två komponenter: (1) kärnenzymet och (2) sigmafaktorn. Holoenzymet kan symboliseras som a2p3 'a. !

1. Kärnenzymet:

Kärnenzymet kan inte initiera transkription på de korrekta ställena, men det kan syntetisera RNA med användning av DNA som en mall.

Kärn-RNA-polymeraset består av fyra polypeptider som har följande tre typer:

(a) a-underenheten:

Det är närvarande i två kopior / kärn-enzymmolekyler, och är inblandad i bindning med promotor-DNA. Den exakta mekanismen för dess bindning med DNA är okänd.

(b) P-underenheten:

Det är närvarande i en enda kopia / enzymmolekyl, och är involverad i bindning med inkommande nukleotider för RNA-syntes. Anmärkningen av de korrekta nukleotiderna motsatta DNA-baserna verkar vara baserad på deras övergripande geometri i förhållande till varandra snarare på basparets beteendebeteende.

(c) P-subenheten:

Det är involverat i bindning med mall-DNA, dvs den enkelsträngade DNA-sträckningen genereras för att tillåta transkriptionen att fortsätta.

Varje subenhet bidrar till funktionen av kärnenzymet som en helhet, som bör ha åtminstone följande fyra distinkta funktionella platser.

(i) En DNA-avvecklingsplats som håller att avveckla DNA-duplexen när kärnenzymet rör en bas i taget längs DNA som transkriberas.

(ii) Platsen bindande till "antisenssträngen", strängen som transkriberas.

iii) En annan plats binder till "sense-strängen", strängen komplementär till "antisenssträngen" av DNA-transkriberingen.

(iv) Ett DNA-återspolningsställe är avsett att återspola de två strängarna av DNA till en normal duplex.

2. Sigma-faktorn:

Sigma-faktorn är involverad i stabil bindning av RNA-polymeraset till promotor-DNA; och eventuellt med transkriptionsinitiering. Det är inte inblandat i transkriptionen i sig (dvs. RNA-syntes) som den släpps när RNA-kedjan når 8-9 baser; kärnenzymet fortsätter sedan transkription.

RNA-polymeras i eukaryoter:

Alla eukaryoter har tre separata klasser av RNA-polymeras som kallas RNA-polymeras I, RNA-polymeras II och RNA-polymeras III.

RNA-polymeras I:

Detta enzym ligger i nukleolus och ansvarar för transkriptionen av ribosomalt RNA.

RNA-polymeras II:

Detta polymeras är belägen i nukleoplasman som är en del av kärnan annan än nukleol. Detta enzym är huvudkomponenten av RNA-polymerasaktivitet, och det transkriberar alla gener som producerar mRNA. I eukaryoter är transkriptet initialt i form av mRNA-prekursorer, som heter heterogen nukleär RNA (hn RNA) som senare behandlas till mRNA.

RNA-polymeras III:

Detta enzym inträffar i nukleoplasma och transkriberar tRNA- och 5S-RNA-gener.

Organellar RNA-polymeras:

Förutom de nukleära RNA-polymeraserna I, II och III har eukaryota celler en liten mängd RNA-polymerasaktivitet i deras organeller, dvs mitokondrier och plastider. Dessa polymeraser är nödvändiga för att transkribera relativt få gener närvarande i dessa organeller. Dessa enzymer verkar vara analoga med fag RNA-polymeraser.